2008年初，北京国安与上海申花就王珂的转会费僵持不下。国安咬定130万，申花坚持140万。眼看10万元的差价就要让转会告吹，一心想北上发展的王珂做出了一个令人意外的决定：自己借钱也要补上这10万，成全这次转会。

后来，国安方面了解到王珂家境贫寒（父亲早逝，母亲身体不好），出于同情，最终将报价提到了140万，才让这笔转会尘埃落定。这个略显心酸又充满温情的开头，开启了王珂的国安生涯。

到了国安，主教练李章洙对他十分欣赏，视其为“必须拿下的内援”。但融入新球队的过程并非一帆风顺。

2009年初在昆明海埂冬训时，队内进行趣味性的网式足球比赛，因为有奖金刺激，大家争夺异常激烈。在一次争顶高球时，王珂因为没像其他队员那样喊叫提醒，导致与队友发生误会，被对方的后脑勺结结实实地撞中了鼻梁，当场血流不止，把大家都吓了一跳。

好在队医检查后确认只是皮外伤，虚惊一场。这个“血染训练场”的小插曲，成了他国安岁月里一个令人哭笑不得的注脚。

2009赛季对王珂和国安都是特别的。那个赛季，北京国安时隔16年重夺顶级联赛冠军。

对于王珂而言，这个冠军意义非凡——这是他职业生涯的第二个顶级联赛冠军，第一个是2003年随上海申花获得的末代甲A冠军。

夺冠后，他骄傲地说：“我现在可是在两支球队里拿过冠军的人啦！” 不过，喜悦中也夹杂着一丝遗憾，在那场决定冠军的比赛中，他未能进入首发名单，只能在替补席上为队友加油。

更具戏剧性的是，国安夺冠路上的关键对手之一杭州绿城，其主教练正是王珂在申花时的恩师吴金贵。

赛前，王珂笑谈这场“师徒对决”：“真巧啊，我这个当学生的要和当年的教练吴指导PK了。” 他坦言面对旧主和恩师心情复杂，但上了场就会拼尽全力。

最终，国安取胜夺冠，而绿城不幸降级，王珂也不得不感慨竞技体育的残酷。

从自掏腰包完成转会，到训练场上的“血光之灾”，再到成为“双冠”福将并与恩师赛场对决，王珂的国安岁月充满了这些充满人情味和戏剧性的小故事。